Kallman-ov sindrom tip 2 (KS2) je tip kongenitalnog hipogonadotropnog hipogonadizma udruženog sa anosmijom. Uzrokovan je mutacijama na FGFR1 genu i manifestuje se odloženim pubertetom i oštećenjem čula mirisa. Kod ovih pacijenata mogu se uočiti urođene mane poput deformacija prstiju, ageneze zuba, rascepa usne ili nepca, koje mogu ukazati na postojanje genskih defekata. Većina pacijenata sa KS2 sindromom dobro reaguje na hormonsku terapiju, razvijaju normalne seksualne karakteristike i mogu da imaju decu.