Tromboza mezenterične arterije nastaje usled formiranje krvnog ugruška unutar gornje ili donje mezenterične arterije. Ovo stanje, ne samo da povećava rizik od tromboembolije, već može dovesti do ishemije mezenterijuma i akutne okluzije mezenterične arterije, oboljenja koje prati visoka stopa morbiditeta i mortaliteta.